Naturhistoriska riksmuseet är Sveriges största museum och en ledande forskningsinstitution där nyfikenhet möter vetenskap. Vi är en statlig myndighet som ökar kunskapen om och intresset för naturen och världen vi lever i genom forskning, unika samlingar och upplevelser som Cosmonova, utställningar, aktiviteter på museet och digitalt. Tillsammans skapar vi insikt, engagemang och handlingskraft för en livskraftig planet.
Enheten för populationsanalys och övervakning utför uppdrag åt ett flertal myndigheter och organisationer. Enheten består av flera arbetsgrupper som utför dels övervakning av marina och terrestra däggdjur och dels genomför ett stort antal genetiska analyser. Enheten bedriver forskning och övervakning av tumlare och säl på uppdrag av Havs och vattenmyndigheten och övervakning av björn, kungsörn och fjällräv på uppdrag av Naturvårdsverket. De genetiska analyserna utförs av Centrum för Genetisk identifiering (CGI) åt ett flertal olika aktörer inom natur- och miljövård och inbegriper en mängd olika frågeställningar.
Till enheten söker vi nu en postdoktor till arbete med analys av genomiska data från sill inom ett FORMAS-projektet.
Projektets huvuduppgift är att bearbeta och analysera ~100 genom från östersjövikaren (Pusa hispida) för att bedöma deras populationsstruktur, demografiska historia och anpassningsmönster. Baserat på dessa resultat kommer diagnostiska markörer att utvecklas och genotypas för ~400 vikare från Bottenvikens population. Simuleringar kommer också att användas för att bedöma de framtida effekterna av klimatförändringar och jaktmetoder på vikarbestånden.
Databehandling kommer att omfatta användning av bioinformatiska verktyg och pipelines som utvecklats för stora genomiska datamängder för att kartlägga rådata och sekvensvarianter, inklusive punktmutationer och strukturella varianter. Dataanalyser kommer att innefatta bedömning av populationsdifferentiering, kvantifiering av genflöde, rekonstruktion av tidigare populationshistoria, uppskattning av inavel och genetisk belastning och identifiering av möjliga adaptiva loci. Baserat på dessa resultat kommer den framgångsrika kandidaten att utveckla diagnostiska markörer för långsiktig genomisk övervakning av arten (dvs struktur, genflöde, uppskattning av populationsstorlek). Slutligen kommer projektet att använda artdistributionsmodellering (t.ex. Maxent) med hjälp av nuvarande och framtida miljövariabler och aktuella förekomstdata för att bedöma östersjövikarens framtida utbredning. Projektet kommer också att använda genombaserade simuleringar (t.ex. SLIM) för att undersöka genomiska respons på uppvärmning av haven och relaterade förändringar i miljöförhållanden. Kandidaten förväntas förbereda manuskript för publicering i internationella tidskrifter med stor genomslagskraft och presentera resultat vid nationella och/eller internationella konferenser. Eftersom detta projekt är finansierat av Naturvårdsverket (SEPA) kommer kandidaten och huvudutredaren (Dr. Nicolas Dussex) att delta i regelbundna möten med en referensgrupp från Naturvårdsverket och olika intressenter för att bedöma milstolpar och presentera projektets framsteg.
Projektet kommer också att involvera modern provtagning av vävnad från NRM:s miljöprovbank, DNA-extraktion och genotypning med hjälp av huvudutredare och medutredare. Historiska prover kan också hämtas från museets samlingar.
Den framgångsrika kandidaten kommer också att uppmuntras att utveckla sina egna forskningsidéer och att ansöka om egen finansiering (t.ex. Marie Curie, Vetenskapsrådet) för att bygga vidare på detta projekt eller sina egna projekt, med hjälp av huvudutredare.
Krav:
Doktorsexamen i evolutionsbiologi, molekylär ekologi, genetik eller bioinformatik, avlagd inom de senaste tre åren.
Erfarenhet av att bearbeta stora moderna och historiska datamängder med hjälp av bioinformatiska arbetsflöden, såsom GenErode
Erfarenhet av att hantera helgenomdata (WGS) och genomföra populationsgenomiska analyser (t.ex. PCA, selektionstester, analyser av introgression, inavel och skattning av genetisk belastning)
Erfarenhet av att använda temporala genomiska data för att studera populationsförändringar över tid
Erfarenhet av analyser av återhämtande populationer i syfte att stödja artförvaltning (t.ex. definition av förvaltningsenheter)
Erfarenhet av modellering av interaktioner mellan genom och miljö
Kunskap om genom-baserade simuleringar (t.ex. SLiM), styrkt genom genomgången kurs i SLiM, samt erfarenhet av populationsmodellering av sälar
Erfarenhet av reproducerbara pipelines och FAIR-kodning
Erfarenhet av statistiska analyser
Goda kunskaper i engelska i både tal och skrift
Meriterande:
Erfarenhet av artdistributionsmodellering (SDM) och genominformerade simuleringar (t.ex. SLiM)
Erfarenhet av laboratoriearbete, inklusive DNA-extraktion
Erfarenhet av beredning av sekvenseringsbibliotek från modernt och historiskt material
Goda kunskaper i svenska eller annat skandinaviskt språk
För att lyckas i rollen planerar, organiserar och prioriterar du ditt arbete effektivt och bygger strukturer som andra också kan arbeta utifrån. Du anger och håller tidsramar. Du identifierar, hanterar och följer upp detaljer i arbetet och utför arbetsuppgifter på ett grundligt sätt. Du uppmärksammar andras synpunkter och kompetens på ett sätt som gynnar helheten. Du bidrar till att tydliggöra gruppens uppgifter på ett sätt som gynnar hela gruppen och utvecklar relationer. Du delar med dig av din kunskap.
Tillträde så snart som möjligt enligt överenskommelse. Anställningen är tidsbegränsad till 24 månader.
6 månader eller längre.
För att ansöka, vänligen skicka in följande material:
1) ett personligt brev på en sida som beskriver ditt intresse för tjänsten
2) C.V. som beskriver dina färdigheter och expertis samt inkludera kontaktinformation för minst två referenser.
På Naturhistoriska riksmuseet arbetar vi för en hållbar och livskraftig planet, där alla medarbetare är en viktig del av en större helhet. Vårt uppdrag är brett och våra mål högt satta. För att nå dem behövs allas erfarenheter och kompetenser.
Vi strävar efter att vara en arbetsplats med stark gemenskap, där vi delar med oss av vår kunskap och firar våra framgångar.
Tillsammans vill vi skapa en trygg, kreativ och ansvarstagande arbetsmiljö. Vi erbjuder flexibla arbetstider, friskvård och kompetensutveckling.
Hos oss tillämpas individuell, differentierad och saklig lönesättning enligt kollektivavtalen RALS/RALST-T.
På Naturhistoriska riksmuseet arbetar vi för att vår verksamhet ska spegla samhället och välkomnar alla sökanden oavsett kön, bakgrund, ursprung eller funktionsvariation.
Inför rekryteringsarbetet har vi tagit ställning till rekryteringskanaler och marknadsföring. Vi undanbeder oss därför kontakt med mediesäljare, rekryteringssajter och liknande.